lammps分子运动模拟
如图，我想将上方红色的分子向上运动离开下面的槽结构，但是由于周期性原因遭到顶部原子的阻挡，该怎么解决？？
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在弛豫的过程中这种情况应该肯定会发生的吧，有温度下面又有空间，分子扩散很合理呀。你说的让分子向上运动是什么意思？
试试选用非周期性边界条件
象这个应该是z方向为非周期性条件。最上方出现原子感觉是周期性的结果，你可以持续输出结构看一下
谢谢您的回答，这几天我重新建模，发现这是MS模型导出的原因
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