想做一个蛋白质分子与辅酶和底物对接的模型,一般用什么软件比较靠谱,有高手可以做吗? 返回小木虫查看更多
这个得具体看,如果该酶有已知的晶体结构,有已知的活性位点信息,并且待对接底物的可旋转键不是很多,那对接结果一般是可信的。反之,则可信度就差一些。
已私信
请问你的分子对接做出来了吗?我最近也需要做,能分享一下你的软件和教程等资料吗?跪谢了!
这个得具体看,如果该酶有已知的晶体结构,有已知的活性位点信息,并且待对接底物的可旋转键不是很多,那对接结果一般是可信的。反之,则可信度就差一些。
没有晶体结构,只用swiss-model做了建模,底物是丙酮酸和NH4+,辅酶是NADH,以前用Autoduck做过,但效果不理想
有同源性比较高的酶,上次的建模也是用的一个同源性比较高的模板,有相关文献已经做个这个酶和底物作用的分子解析,他们采用的蛋白晶体制作的模型。请教如果可以做的话用什么软件比较好?你做过类似的模型吗
,
已私信
请问你的分子对接做出来了吗?我最近也需要做,能分享一下你的软件和教程等资料吗?跪谢了!