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同样的初始构型与in文件,模拟结果与并行核数有关,如何解决?

作者 sandy950111
来源: 小木虫 250 5 举报帖子
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如题,我用LAMMPS做一个NEMD,用nose-hoover控压控制水的压力,模拟水滴的两相过程。
但是用20核并行和用100核并行结果有着显著差异,请问这可能与什么有关?应该尝试改变哪些模拟参数以消除?
我采用的水分子模型为TIP4P-2005,timestep=2fs,采用fix shake算法。

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  • 精华评论
  • iSimuLy

    显著 差异是指

  • iSimuLy

    系综平均的物理量才有可比性

  • sandy950111

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by iSimuLy at 2017-06-11 13:20:01
    显著 差异是指

    您好,显著差异是指:
    20核模拟中,并未因压力降低产生两相现象,即液体转变为水蒸气。
    100核模拟中,因压力降低产生了液体转变为水蒸气的结果,并且随着模拟时间的进行该转变愈发明显。

    两个模拟中的data文件与in文件都一致。
    我对20核和100核的模拟均进行了多组进行确认。20核的模拟结果相互一致,100核的模拟结果也相互一致。所以这种差异应该是由于并行的核数不同导致的,但是为什么会有这种结果我无法理解

  • MS_Z

    水的模拟timestep一般不都取1fs么……不过这个既然是一样的in文件 这个应该影响不大 不过并行核数确实会对结果有影响 不会影响这么大还是第一次听说 关注一下

  • 有风的日子qq

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by sandy950111 at 2017-06-11 14:14:15
    您好,显著差异是指:
    20核模拟中,并未因压力降低产生两相现象,即液体转变为水蒸气。
    100核模拟中,因压力降低产生了液体转变为水蒸气的结果,并且随着模拟时间的进行该转变愈发明显。

    两个模拟中的data文件 ...

    您好,我也出现了差异,请问你是怎么解决的?

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