关于lammps计算配位数问题
请问我的这个计算配位数的问题,输出总是报错,该怎么输出呢?
compute coord workpiece coord/atom cutoff 1.0 3 1*3
dump 2 workpiece custom 100 si1.lammpstrj id type x y z c_coord
ERROR: Dump custom compute does not calculate per-atom vector (../dump_custom.cpp:1363)
返回小木虫查看更多
今日热帖
你这个error已经提示了,说compute不能计算per-atom vector啊,还有配位数不是径向分布函数的积分?这个是后来的数据处理的事么,能够直接输出出来么
文献里有一个工件根据配位数着色的问题,这个应该是算出来的。我把后面的1*3删了,可以输出。顺便请教个问题,就是compute coord workpiece coord/atom cutoff 1.0 3 1*3,我这个命令后面的3 1*3,这是原子类型3给原子类型1*3贡献吗?还是怎样?有点懵
,
这个我也不太清楚,我也没用过这个命令。。。
还有一个疑问就是截断距离是1埃吗?如果是的话,这么小的距离,怎么可能得到一个配位数