如图中文字所述,要找到AC 分子的偶极矢量夹角与质心坐标的关系,有两个问题: 1.在MS中怎么样才能找到分子的偶极矢量方向? 2.如何可以找到质心,因为分子比较多,一个一个的找很繁琐,想问下有木有简单的方法可以全部找出来? 返回小木虫查看更多
就是计算分子偶极距投影到垂直于分子吸附表面轴上的分量
具体是什么分子呢?还有,你的很多分子有多少?是用动力学处理的吗
个人觉得要用轨迹文件,因为算夹角和坐标有关,而每一步的构象坐标都不相同
你处理的是丙酮的话,分子是对称的,那可以先用ms找一个分子的质心,
就是计算分子偶极距投影到垂直于分子吸附表面轴上的分量
具体是什么分子呢?还有,你的很多分子有多少?是用动力学处理的吗
200个丙酮分子。是做动力学处理的,不过我有个疑问:在做偶极矩的时候,是要分析平衡后的轨迹文件,还是分析其中某一个,个人觉得应该是轨迹文件,只是不清楚具体该怎么做
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个人觉得要用轨迹文件,因为算夹角和坐标有关,而每一步的构象坐标都不相同
你处理的是丙酮的话,分子是对称的,那可以先用ms找一个分子的质心,