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请问怎么找到各个分子的偶极矢量

作者 yeahhanpei
来源: 小木虫 700 14 举报帖子
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如图中文字所述,要找到AC 分子的偶极矢量夹角与质心坐标的关系,有两个问题:
1.在MS中怎么样才能找到分子的偶极矢量方向?
2.如何可以找到质心,因为分子比较多,一个一个的找很繁琐,想问下有木有简单的方法可以全部找出来?

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  • 精华评论
  • dingweilu

    就是计算分子偶极距投影到垂直于分子吸附表面轴上的分量

  • dingweilu

    具体是什么分子呢?还有,你的很多分子有多少?是用动力学处理的吗

  • yeahhanpei

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by dingweilu at 2017-07-24 09:43:22
    具体是什么分子呢?还有,你的很多分子有多少?是用动力学处理的吗

    200个丙酮分子。是做动力学处理的,不过我有个疑问:在做偶极矩的时候,是要分析平衡后的轨迹文件,还是分析其中某一个,个人觉得应该是轨迹文件,只是不清楚具体该怎么做

  • dingweilu

    个人觉得要用轨迹文件,因为算夹角和坐标有关,而每一步的构象坐标都不相同

  • dingweilu

    你处理的是丙酮的话,分子是对称的,那可以先用ms找一个分子的质心,

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