1、过渡态虚频振动模式对，并不能保证过渡态对，还要看irc。
2、要比较自由能，电子能只是一般情况下可以近似。

1过渡态不会比反应物能量低的
2在没有找到过渡态之前都不能肯定没有过渡态

处理这种问题时得看你计算的体系，处理方法不一定一样。简单举几个例子
1. 一般来说，如果优化收敛的结果是过渡态，说明在此构型下它存在，但不一定是你想要的那个。做IRC，确定连接是否正确。
2. 优化完后，把反应物、过渡态和产物在实验温度下做一个热校正，比较相对Gibbs自由能，这个是判断反应可能性的标准。
3. 如果是双分子反应，过渡态比反应物或是产物的能量代，必须要考虑是否有络合物中间体存在，一般这个情况对双分子反应多一些。
4. 如果你就想确定在某两个构型状态下是否有过渡态，也可以直接做关键变量的势能面扫描，看能量图就知道有没有近似一级鞍点的出现。
暂时这些。具体的分析和应用什么技术，还得看体系的情况。