大家好,最近在做金属离子配合物的时候遇到一些问题,希望能得到大家的帮助^_^
大家好,最近在做金属离子配合物的时候遇到一些问题,希望能得到大家的帮助^_^
对于Cu2+与水和乙二胺(en)的络合物:[Cu(H2O)6]2+、[Cu(en)(H2O)4]2+、[Cu(en)2(H2O)2]2+、[Cu(en)3]2+。由于Cu2+共有27个电子,水分子或乙二胺分子都是偶数个电子,所以整个体系默认采用开壳层计算。对其进行成键轨道分析(NBO)的时候,由于结果没有显示Cu--O键成键,然后用了”$CHOOSE”关键词对其化学键进行指定,对于开壳层体系需要分别指定alpha电子和beta电子,例如下图[Cu(H2O)6]2+,其部分输入文件如下:
$NBO $END
$CHOOSE
ALPHA
LONE 1 9 2 1 4 1 6 1 8 1 10 1 12 1 END
BOND s 1 2 S 1 4 S 1 6 s 1 8 s 1 10 s 1 12
s 2 3 s 2 19
s 4 5 s 4 17
s 6 7 s 6 18
s 8 9 s 8 16
s 10 11 s 10 15
s 12 13 s 12 14 END
END
BETA
LONE 1 8 2 1 4 1 6 1 8 1 10 1 12 1 END
BOND s 1 2 S 1 4 S 1 6 s 1 8 s 1 10 s 1 12
s 2 3 s 2 19
s 4 5 s 4 17
s 6 7 s 6 18
s 8 9 s 8 16
s 10 11 s 10 15
s 12 13 s 12 14 END
END
$END
现有如下的一些问题:
1、查阅文献得到中心离子Cu2+应该属于SP3d2杂化,Cu--O键的成键是由Cu2+提供空轨道,O原子提供孤对电子。对于ALPHA和BETA下的LONE那两行,在分别指定各个原子的未成键电子时,对于Cu2+,最外层应该是17个电子,alpha电子和beta电子分别指定为9个和8个有问题吗?如果有问题,对于提供空轨道的Cu2+该如何指定。
2、对于上个问题的NBO输出文件应如何分析其alpha轨道和beta轨道。
3、后期还需要做一些Zn2+与水和乙二胺络合物的计算,此体系应属于闭壳层体系,这时候的NBO结果能和Cu2+的结果进行对比吗?
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为什么要用CHOOSE指定。试试什么关键词都不加,直接让NBO程序自动确定lone pairs
请问您刚开始怎么学习的高斯啊?
明白你的意思了。没有Cu-O键是因为Cu-O对应的双原子密度矩阵块的布居数远达不到2,从而无法构建Cu-O的NBO轨道。这说明你的体系无法用经典的Lewis结构去描述,只能用共振式去描述。因此,应该用NBO的NRT去算,关于这个我就不太熟悉操作了
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