MS导入Lammps原子跑偏问题
求助：用MS建模，本来在下面的原子经过导入Lammps后跑到了上面，这个是什么原因？该怎么解决呢？
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周期性边界吧
谢谢回答。那怎么修改能够恢复的原来的样子？因为这样会影响后续的操作，修改data文件吗？
边界问题，周期性我觉得没啥影响，在计算时候采用最小镜像法，应该没问题
谢谢大神回答，可是我不懂什么是最小镜像法，百度也没能找到有用的信息。问题是现在仿真时红色原子就会从本来是封闭蓝色原子现在跑到上面的那个通道跑出去，没有约束了
谢谢大神回答，可是我不知道什么是最小镜像法，百度也没找到可用信息。问题是仿真时红色原子会从本来是封闭的蓝色原子现在跑到上面的那个通道跑出去，没有约束了、
我说的可能不准确，是minimum image convention。这个可以参考樊老师的博文
谢谢回答，我尝试增加了体系尺寸
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