有偿!求大神教学做系统发育树
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价格大神说了算哦~
我查到文献的大致流程是这样子的:运用National Center for Biotechnology Information(NCBI,https://www.ncbi.nlm.nih.gov)中的BLAST工具进行核酸序列比对。用chromas软件查看测序峰图并与测序结果进行比对,必要时手动修改。修改后的序列在GenBank中比对,下载相似度较高的序列及其对应的模式菌序列(表2)。用ClustalX2.0.10软件将分离得到的代表菌株和下载序列比对剪切,按ITS-ACT-GAPDH-CHS-TUB-CAL顺序收尾相连,以Monilochaetes infuscans(CBS869.96)作为外群,用PAUPv4.0b10软件以最大简约法(MP)构建系统发育树。
但是由于本人刚刚入手,基础还比较差,出现了各种各样不明白的问题,所以希望大神在线(或者以各种形式)教我做一下。
我的QQ:346405312
希望有时间的大神帮助一下我~谢谢! 返回小木虫查看更多
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求教学做几种炭疽菌的系统发育树,有偿,课时费大神说了算哦~可以在线或者各种方式教学。
我能做,什么菌?几个位点的序列串联?
你好~不好意思给您回复晚了。
是炭疽菌 Colletotrichum,6个序列串联的。现在已经摸索着下完了建树模式菌种,剩下的还是不会,请教教我~
你用多位点串联序列想鉴定到哪个水平,种间还是种下?选了哪些位点?是ITS还是编码蛋白基因序列?不同类型的序列选择的处理方法不一样的
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