难道是配位显色吗

可能是低分子量的时候有很多不反应键与你阻聚剂形成空间结构的物质有颜色变化

按道理低分子量反应活性更高啊

对的,低分子空间结构更多

从楼主的描述来看，只有聚酯二元醇分子量的区别，不知楼主的聚合温度和加入阻聚剂时的温度是多少度？体系中有没有水？
如果是温度比较高的，可以从下面的角度考虑一下，低分子的聚酯二元醇受热容易降解，产生的自由基与阻聚剂反应可能生成带色物质，高分子的耐热能力强，不容易降解。