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纳米液滴在电场中的行为

作者 四少爷灬
来源: 小木虫 150 3 举报帖子
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小白入门分子模拟,想通过packmol建立氮气环境和水滴的pdb文件,但是需要tip3p水分子模型氮气分子的.pdb文件,请问大神们如何获取,如果需要自己画该用什么软件

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  • 精华评论
  • zx108s221

    http://www.orsi.sems.qmul.ac.uk/downloads.html
    这个网站有水相关的data文件 你可以提取其中的坐标用来写pdb文件
    氮气这么简单的双原子气体 你自己根据键长写一个不就行了

  • zx108s221

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by 四少爷灬 at 2017-12-05 18:55:57
    不是化学专业的 入门有点难 劳烦大神 氮气的模型和力场该怎么选呢
    ...

    我也不是化学专业的 但是要用lammps就得琢磨明白这些东西
    对于N2这么简单的分子 你稍微查点文献就可以搞的非常清楚了 比谁教都有效果

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