torque里修改stack size
在一台服务器上装了torque，本机作为server也作为计算节点，但是在提交vasp计算任务时，总会遇到
mpirun noticed that process rank 14 with PID 80004 on node silverstar exited on signal 11 (Segmentation fault).
这个问题以前的解决方法是在.bashrc里面添加一行
ulimit -s unlimited
这样的话，在本机直接用mpirun运行vasp就没有报错，但是现在用torque提交计算后在任务日志里就出现这样一行
/home/lxm/.bashrc: line 17: ulimit: stack size: cannot modify limit: Operation not permitted
所以应该是由torque提交的任务还是受内存限制，不能继续运行。
请教这个问题有什么解决办法？
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京公网安备 11010802022153号
pbsdsh -u ulimit -s unlimited
谢谢回复，我在pbs脚本里面加上这一行以后，出现这个错误：
PBS: ulimit: No such file or directory
pbsdsh(): task 0 exit status 254
然后vasp还是报错退出，请帮忙看看是什么原因。
pbs只是作业管理系统，你如果有错误，肯定是执行程序的过程中出错，你可以先在终端执行下，有错误的地方研究下，往往是库路径的不同导致的。/home/lxm/.bashrc: line 17: ulimit: stack size: cannot modify limit: Operation not permitted，权限错误，说明这一行你普通用户执行是有错误的。
楼主知道torque软件提高任务优先级的命令吗？
谢谢回复，这一行在普通用户的bashrc文件里面执行起来是没有问题的，也能解决vasp程序报的错，但是在pbs里面就无法执行，有权限问题，所以我觉得要是能让pbs解决这个权限问题就应该没问题了
，
抱歉，我现在只使用torque的默认排队设置，所以不了解提高任务优先级的命令。
/home/lxm/.bashrc: line 17: ulimit: stack size: cannot modify limit: Operation not permitted，普通用户没有这个权限的话，可以直用root将limit -s unlimited加在/etc/profile最后面，执行的时候在pbs中加上source /etc/profile就可以了