PCR扩增的片段，可以不经酶切直接作为目的基因与载体进行连接么？
扩增的片段一般为平端，连接率很低吧？
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肯定要酶切啊，不然不互补，你让它怎么连接
可以啊，平端对平端就可以了。不过你要跑胶纯化一下，否则连上的都是引物二聚体
要保证你切质粒用的酶能产生平端。还有要用高保真酶，普通taq酶会自动加一个A，不是完美平端。
最后这种平端对平端，不能保证方向。所以50% 的可能DNA在质粒上是反的，不过有时候不重要，看具体情况
，
还有这么多问题哦