一是差分电荷密度，二是电荷密度差，肯定有区别

一主要用于表面吸附，界面复合，等，二主要用于掺杂之类的

要看电子转移的话第一种比较好

之前帖子里的讨论 http://muchong.com/t-2129228-1
对应楼主所发的，方法一可以称为 Difference charge density，相关内容可以看看异质结（Heterostructure）有关的文章。
方法二可称为 Deformation charge density，看到相关做原子成键分析的比较多。
欢迎交流，