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yuntaishan2008

金虫 (正式写手)

[求助] 求助!!!精子RNA提取!!!!已有2人参与

我最近提精子RNA浓度可以但 A260/A280比值一直上不去,一般在1.5-1.65之间,这是什么问题,求各位大师指导?操作步骤如下:

1、将冷冻精子从液氮罐中迅速取出后,在37 °C水浴锅上30S内解冻到1.5mL无RNA酶的离心管中(样品量160ul),4°C条件下1000 r/min离心3 min,弃上清。2、用DEPC处理过的预冷到4°C的PBS缓冲液洗涤沉淀两次,1000 rpm/min离心3min,弃上清。
3、向沉淀中加入1ml的Trizol,祸旋震荡,在室温下静置5 min。
4、向离心管中加入20 uL β-硫基乙醇,混勻,65°C,水浴30 min,取出后冰浴1 min.。
5、向离心管中加入0.2 mL的氯仿,手动用力震荡15s,室温孵育10min,12000 rpm 4 °C离心15min。
6、离心后溶液分为三层,小心吸取上层水相至新的无RNA酶的离心管中。
7、二次氯仿抽提蛋白
8、向离心管中加入等体积的异丙醇,轻轻反复颠倒混勻,室温静置lOmin, 12000 rpm离心10 min。
9、离心后试管底部会出现沉淀,此为提取出来的RNA。小心弃去上清,缓慢的沿离心管壁加入DEPC水配制的75%的乙醇1 mL,切勿触及沉淀,轻轻上下颠倒洗涤离心管管壁,12000 rpm 4 °C离心5 min后小心弃去乙醇。
10、室温干燥燥沉淀2-3 min,使乙醇完全挥发,用30ulDEPC处理的水溶解沉淀后,于-80 °C保存备用。
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linhaobua

禁虫 (小有名气)

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2楼2018-04-27 22:57:45
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yuntaishan2008

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by linhaobua at 2018-04-27 22:57:45
首先A260/A280只是一种指标,不能那么苛求。
A280是蛋白的吸收波长,说明蛋白在抽提的过程中没有抽提干净,在吸取氯仿离心后的上清时要注意,可以少吸取。
最后 ,干燥沉淀的时间还是有些短,可以适当的延长时间
...

谢谢您的热情帮助,我按照您的建议试试啊!如有问题,还望您多多赐教啊!
3楼2018-04-28 11:08:36
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xiao2189818

金虫 (正式写手)

您好,请问下,您的精子RNA 现在提的效果如何
4楼2020-07-23 17:08:11
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yuntaishan2008

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by xiao2189818 at 2020-07-23 17:08:11
您好,请问下,您的精子RNA 现在提的效果如何

效果不好,有待高人指点啊
5楼2021-07-26 21:00:01
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wodezxn

金虫 (正式写手)

不要做精子RNA,太难做。不能按照其他细胞来对待。降解形式的小片段,量很少。

发自小木虫Android客户端
6楼2022-08-18 11:26:44
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郝静晨

新虫 (初入文坛)

请问你现在做的怎么样了

发自小木虫Android客户端
7楼2023-05-12 16:53:24
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liwolf01

铜虫 (小有名气)

外行弱弱的问一下,氯仿那么强烈的东西不会破坏细小的蛋白质结构吗?

发自小木虫IOS客户端
8楼2023-08-11 11:59:37
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fengaiqin

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
还是植物好: 金币+5, 感谢应助 2024-05-27 10:59:22
不知道你提取精子的RNA是用于做什么实验,如果是自己做PCR,应该是没有影响的;如果是送检做转录组的话,目前公司对这个也没有要求了,精子RNA比较特殊,都是小片段,没有核糖体RNA的18s和28s,所以RIN值也没有参考意义
9楼2024-05-07 11:13:41
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