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空间转录组
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为什么要做空间转录组？ 1. 细胞类型鉴定完之后，可能会发现对照组和处理组的细胞类型差不多，但是表型却大同小异。同样类型的细胞，为什么在不同样本中的表现差异如此之大？基因表达不同的缘故吗？那又是什么因素导致相同类型的细胞基因表达差异如此之大？ 2. 通过降维聚类，特征相似的细胞聚集在一起。基因表达相似，便代表这一群细胞行驶的功能是一样的吗？既然特征相似，为什么细胞和细胞之间，在二维平面上的分布还是有一定距离？聚类之后的细胞分布，和细胞在组织上的真实分布有什么关系？ 3. 细胞的异质性是真实存在的，而在单细胞水平下是研究是以群（cluster）为最小单元，这样分析是否合理？以群为单位，是否会掩盖或忽略掉细胞之间的关键信息？ 4. 单细胞水平下分析得到的细胞分化发育轨迹，或细胞和细胞之间的通讯联系，在空间上是否真实分布在临近区域？不同细胞之间的联系，是直接，还是间接？或者反过来，单细胞水平下分析得到的功能相似的细胞群体，在组织中的分布，一定是在同一区域吗？ 这些问题，如果仅仅靠单细胞一个层面的数据，是很难解释清的。所以需要在单细胞的基础上，联合空间转录组，二者相互印证，才能获取更真实的信息。 所以现在选择我们只需要10999哦  |
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