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goldenfisher

金虫 (著名写手)

[交流] 【原创】第一原理分子动力学:BOMD和CPMD的比较!已有22人参与

很长一段时间以来,一直有人在问BOMD与CPMD究竟有什么不同?这里我就简单说一些二者的区别。
实际上,我想大部分人理解和接触的第一原理分子动力学方法以CPMD居多。CPMD,就是Car和Parrinello两个人作出的基于密度泛函的分子动力学方法,其特点是在引入电子虚拟质量,将电子运动耦合到了运动方程中,每一步分子动力学计算后,对电子结构的计算就不再需要自洽场迭代这一过程,因此可以大大节省计算资源,在计算机还不是那么好的80,90年代是弥足珍贵的。CPMD的建立开创了第一原理分子动力学方法的新时代,使其真正开始了实用化进程。
而BOMD,顾名思义,就是Born-Oppenheimer分子动力学。Born-Oppenheimer近似,也就是绝热近似,指的是将电子和离子的求解分离开来,只处理离子的动力学部分,而认为电子可以快速跟上电子的运动。其特点是每一步分子动力学计算之后都需要对电子结构进行自洽场迭代,使电子达到基态。正式由于这个自洽场迭代过程需要的计算量巨大,致使其一直没有达到广泛运用,直到90年代中后期,计算机技术的发展,才使BOMD开始逐步被人们重视。
CPMD和BOMD各有优劣。CPMD虽然计算速度更快,不需要进行自洽场迭代计算,计算量小,但是由于计算中并没有使体系真正达到基态,而只是尽量靠近基态,因此其准确性对电子的虚拟质量这个参数的选取依赖程度很大,一旦计算参数不对,得到的体系很可能远远偏离真实的势能面,得不到正确的动力学轨迹。同时,为了保证其尽量靠近基态,分子动力学时间步长一般选得较小。而BOMD虽然计算量大,但是由于每一步都保证系统达到基态,因此其分子动力学步长可以取得较大,一般1fs到5fs都有可能。综合来说,如果能结合二者的优势,第一原理分子动力学计算效率将大大提高,这也成为近年来其发展的重要方向。
关于这部分近年来的发展,可以参考以下两篇文献,以及其参考文献和引用他们的文献。
http://link.aps.org/doi/10.1103/PhysRevLett.98.066401
http://iopscience.iop.org/0295-5075/88/2/20001/?rss=2.0

这部分实际上也是一个研究热点,欢迎大家热辣讨论,并长期关注。
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vasp001

金虫 (正式写手)

★ ★
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zzy870720z(金币+1):感谢交流 2010-05-26 07:56:16
CPMD 用的势场是 on the fly ,而BOMD 用的势场是严格的第一性原理的势场,即从能量对粒子位置求一次偏倒得到。

CPMD 处理金属体系时,引入了热库的概念。来表示电子和离子的耦合。即电子在一定的频率范围以上认为和离子进行有效的耦合,即在一定的频率薄层范围内,都是认为电子和离子进行有效耦合的。
一定要精通MaterialsStudios,VASP.
5楼2010-05-26 06:50:26
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普通回帖

beyondstar

木虫 (正式写手)


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顶,严重支持!!!!!!!!!!!!!
2楼2010-05-25 22:00:23
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zsjan

金虫 (正式写手)


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写得非常好啊!
3楼2010-05-25 22:08:12
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
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zzy870720z(金币+1):谢谢补充 2010-05-26 07:56:04
另外一个CPMD处理金属体系有是不大好的。
4楼2010-05-25 22:41:29
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enola

捐助贵宾 (正式写手)


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谢谢goldenfisher
timeflies..
6楼2010-05-26 08:25:07
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freer007

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
将得好,谢谢楼主分享。
7楼2010-05-26 08:44:06
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xirainbow

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
牛!;)
8楼2010-05-26 09:12:09
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goldenfisher

金虫 (著名写手)

★ ★
hometownlove(金币+2):谢谢交流 2010-05-26 13:29:44
目前大部分CPMD程序只能进行Gamma点的计算,而BOMD可以进行多k点计算。这也是因为CPMD一般处理流体等无对称性的对象,所以Gamma点可以增加计算速度,且不关心体系对称性。
9楼2010-05-26 09:59:38
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quantumfang

至尊木虫 (著名写手)

小木虫中医研究院院长


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
可能不能评价
10楼2010-05-26 10:56:21
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