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长歌怀采薇2024

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于蛋白质组学的几个问题

我对于蛋白的研究不算特别深入,但因为工作中会经常接触到蛋白质研究,比如WB,Chip等。
我比较好奇的是,如果我们得到一个未知的蛋白(单一蛋白or 蛋白复合体)如何鉴定该蛋白质复合体是单一的一个蛋白质,还是通过蛋白质-蛋白质相互作用结合在一起的呢?
这个问题也困扰我比较久了。
举个例子。比如组蛋白是H2A,H2B,H3,H4组合在一起,形成1个8聚体(该8聚体我们认为是8个亚基,通过四级结构形成一个完整蛋白质)。那换个思路,那我是不是也可以看作是2个4聚体通过蛋白质相互结合形成8聚体呢?
由此我还是很好奇,如果得到未知结构的蛋白,你可以通过SDS跑出来比如有10个亚基,那你如何判断该蛋白是由10个亚基,通过四级结构形成一个蛋白质。还是例如其中2个亚基,3个亚基,5个亚基各自形成蛋白质后,再通过3个蛋白质蛋白质相互作用结合形成复合体呢?

另外在WB中,设计线性表位,通常是针对某蛋白质中的某个亚基,那么会不会可能因为两个不同的蛋白质中含有2个完全相同的亚基,而在实验中造成假阳性呢?
求各位网友答疑解惑,谢谢。
#蛋白质结构# #蛋白质组学#

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supervincent

新虫 (正式写手)

蛋白组学可能侧重于对大量已知整体变化的判断,比如疾病中不同阶段的变化。对于未知的蛋白可能用组学的方法不合适。

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2楼2024-04-19 07:38:07
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alicelchf

木虫 (著名写手)

组学也有不同大小分子的分析,你说的情况更适合native mass可以分析结构组成
修身、齐家、治国、平天下
3楼2024-05-31 15:42:13
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