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对基因片段测序结果表示不解,求大神指导

作者 米夏girl
来源: 小木虫 1250 25 举报帖子
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我对炭疽属真菌的CHS(编号D)、TUB2(编号E)、CAL(编号F)三个基因片段分别进行了PCR扩增,并送公司测序。但是对测序结果表示很不理解,问题如图中标注: http://\"对基因片段测序结果表示不解,求大神指导\" http://\"对基因片段测序结果表示不解,求大神指导-1\"
问题说明
【1】图1中,样品D3、D5、D7、D11在胶图中显示为清晰的单一条带,但测序结果全部为“正向双峰”,请问造成这种结果的原因会有哪些?胶图显示为单一条带,但是测序结果为“正向双峰”,但是反向正常,这种现象是什么原因呢?
【2】图2中样品E4、E2、E6、E10、E11在胶图中显示为清晰的单一条带,但测序结果全部为“反向双峰”,但正向是正常的。请问这是什么原因呢?

样品E9、E5、E7、E8条带清晰,但是结果为“双峰无条带,无法回收”,样品F2、F5也有清晰条带,测序结果为“信号弱\无信号”,请问造成上述结果的原因是什么呢? 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • 米夏girl

    引用回帖:
    8楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-08-14 21:18:31
    我就有点纳闷,产物图跑得这么漂亮,不至于结果这么不乐观的。

    既然PCR产物直接送出去测的,那就比较正常了,这个测序结果与切胶回收关系很大。...

    所以我自己切胶,然后再送测序的话,是不是结果会好点?

  • 晋鹏

    引用回帖:
    9楼: Originally posted by 米夏girl at 2017-08-14 21:24:10
    所以我自己切胶,然后再送测序的话,是不是结果会好点?...

    最好的结果应当是:

    1、更换一个技术更好的公司,能够保证PCR产物测通~(于你而言,省时省力)

    2、PCR产物跑胶后(你的结果就很好),购买切胶回收试剂盒,自己切胶回收,转化大肠杆菌,菌液测序~(最可靠)

  • 米夏girl

    引用回帖:
    10楼: Originally posted by 晋鹏 at 2017-08-14 21:31:33
    最好的结果应当是:

    1、更换一个技术更好的公司,能够保证PCR产物测通~(于你而言,省时省力)

    2、PCR产物跑胶后(你的结果就很好),购买切胶回收试剂盒,自己切胶回收,转化大肠杆菌,菌液测序~(最可靠)...

    有同学说800bp以下的基因片段,只要单向测通就可以用,没有必要双向测通并且得到拼接序列,请问这种说法是正确的么

  • 晋鹏

    引用回帖:
    11楼: Originally posted by 米夏girl at 2017-08-14 21:45:46
    有同学说800bp以下的基因片段,只要单向测通就可以用,没有必要双向测通并且得到拼接序列,请问这种说法是正确的么?...

    单向测序:如果你的片段800bp以内,单向测序就OK了。
    测通:单向测序800bp以内的也叫测通。
    800bp以上的片段一般都是双向测序,速度快。

  • 零雨令吾囹圄

    引用回帖:
    9楼: Originally posted by 米夏girl at 2017-08-14 21:24:10
    所以我自己切胶,然后再送测序的话,是不是结果会好点?...

    切胶回收送生工华大等等公司测序都是很容易的,直接写双向测通(现在生工好像直接送切下来的胶都可以,不用自己回收)

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