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同源模建后,蛋白与配体的对接问题

作者 luweidong401
来源: 小木虫 450 9 举报帖子
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各位专家,PDB数据库中一个蛋白结晶与我要分析的蛋白的氨基酸同源性达45%,但是这两个蛋白的底物不同,请问如何分析我的目的蛋白与自身底物的对接情况? 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • luweidong401

    引用回帖:
    8楼: Originally posted by 你好哈- at 2017-10-25 22:49:49
    你可以试试模板蛋白的结合位点,盒子调大一点,多输几poses ,估计位点也就差不多找准了

    如果使用DS的话,大致该如何操作呢

  • luweidong401

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by hellololo at 2017-10-20 14:32:27
    请问楼主用什么建模的,正在学习,谢谢

    用的是DS

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