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[交流]
如何使用CBS-QB3寻找过渡态
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| 已在其他水平下找到了过渡态，打算在此基础上使用CBS-QB3水平下通过IRCmax寻找过渡态，不知道如何写输入文件。想请教一个CBS-QB3做IRCmax的输入文件。 |
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送红花一朵
13楼2019-05-16 11:42:51
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流浪猫小琪(金币+2): 谢谢参与
流浪猫小琪(金币+2): 谢谢参与
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这个没法一步完成。 一般来说IRCMax写法如下： IRCMax(方法2:方法1) 含义是是在方法1的IRC途径上 用方法2在每一个点都做单点能计算，找出其中能量最高的点。 但是CBS-QB3是一个多步骤的方法 其中还包含了第一步一个opt步骤 所以这个不能直接写的。 高斯说明书的原话也是这样说的 ： Analytic gradients are required for the IRC portion of the calculation (model1 above). Any non-compound energy method and basis set may be used for model2. CBS-QB3就是属于 compound energy method。 所以没法直接写。如果需要就只能分步骤人工计算 第一步 先用 方法1 算IRC ， 第二步 自己提取IRC上每一个点的结构 逐一用CBS-QB3做一次单点能 （如果是Gaussian16 就支持CBS(NoOpt）能自动跳过其中的opt步骤 ，给出能量）。但是G09不支持这个写法，那么就要人工来做整个CBS步骤 人为跳过opt步骤。 CBS-QB3除去优化的话需要进行四步骤 1. #p B3LYP/CBSB7 Freq 2. #p CCSD(T)/6-31+G(d') 3. #p Geom=AllCheck Guess=Read MP4SDQ/CBSB4 4. #P Geom=AllCheck Guess=Read MP2/CBSB3 CBSExtrap=(NMin=10,MinPop) 你可以把这四部分的计算都用--link1--来隔开 写在同一个文件里。 http://www.chem.ucla.edu/~mccarren/CBSQB3_worksheet/ 这个网站可以帮你按照CBS-qb3的公式分别取这几个计算中有用的部分加加减减 得到最后的能量。 然后对每一个点都要做一次这些运算。整个运算步骤还是挺多的。 |
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7楼2019-05-15 14:27:13
简单回复
rocisky73楼
2019-05-15 12:08
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2019-05-15 12:18
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