| 查看: 2903 | 回复: 34 | ||||||||||
| 【奖励】 本帖被评价30次，作者zhangguangping增加金币 23.8 个 | ||||||||||
[资源]
MPI的安装(管理员和普通用户均可)
|
||||||||||
|
本版块有的虫友在寻找MPI的安装，我现在把我以前的安装笔记分享出来，这儿以MPICH2和OpenMPI为例子，并且由于笔记比较早，所以版本有些老，对于新版本的安装，大家可以做一下参考。 下面的安装都是以普通用户为例子，如果是root用户安装，流程一样。 （一）MPICH2的安装 (各种版本的下载地址http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/) 1.将mpich-1.2.7.tar.gz文件拷贝到一个临时的目录里面（如tem） 2.解压文件：$tar -zxvf mpich-1.2.7.tar.gz 3.进入解压后的目录：$cd mpich-1.2.7 4. $./configure -prefix=/home/zgp/software/mpich-1.2.7 -fc="pgf77 -Mx,119,0x200000"\ -f90="pgf90 -Mx,119,0x200000"\ -without-romio --without-mpe -opt=-O -rsh=ssh (若要使用的是ifort编译则设置成$./configure -prefix=/home/zgp/software/mpich-1.2.7 -fc=ifort -f90=ifort –f77=ifort -rsh=ssh) 5. $make 6. $make install 7环境配置：vi ~/.bashrc (打开文件.bashrc，按i进入编辑状态) 添加export PATH=/home/zgp/software/mpich-1.2.7/bin:$PATH 关闭之后 source ~/.bashrc(使设置起作用，以后再新进入shell之后直接可以用mpirun) 8.测试：$cd examples $make $mpirun –np 4 cpi ################## 注：下面的这个如果提前对用户配置好免SSH登录的话，就不会出现了，所以建议首先对用户配置免SSH登录，如果是root的SSH免密码登录已经配置好了的话，普通用户只需要进行如下操作即可： ssh-keygen -t rsa 后面直接连着三个“Enter”就可以， 然后运行命令： cat ~/.ssh/id_rsa.pub >> ~/.ssh/authorized_keys ###################### $The authenticity of host 'localhost (127.0.0.1)' can't be established. RSA key fingerprint is c0:48:84:0c:31:93:29:9a:d6:f6:07:08:7b:cc:33:db.Are you sure you want to continue connecting (yes/no)? $yes $Warning: Permanently added 'localhost' (RSA) to the list of known hosts. $zgp@localhost's password: 这时连续输入3次密码出现 $Process 0 on localhost Process 2 on localhost Process 3 on localhost Process 1 on localhost pi is approximately 3.1416009869231249, Error is 0.0000083333333318 wall clock time = 0.003906 表明安装成功。要想无密码并行，参考“ssh 免密码登录设置” 注意：mpich卸载，用/sbin/mpiuninstall文件 （二）OpenMPI的安装 (各种版本下载地址：http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.4/) 1.将openmpi-1.2.6.tar.gz文件拷贝到一个临时的目录里面（如tem） 2.解压文件：$tar -zxvf openmpi-1.2.6.tar.gz 3.进入解压后的目录：$cd openmpi-1.2.6 4.$ ./configure --prefix=/home/zgp/software/openmpi-1.2.6 F77=ifort FC=ifort (./configure --prefix=/home/zhangp/software/openmpi-1.4.3 CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort FFLAGS=-i8 FCFLAGS=-i8) –i8参数是使用Intel编译器编译64位的编译参数，否则是32位的。 关于OpenMPI的编译说明详见官网http://www.open-mpi.org/faq/?category=building#easy-build 5.$make all install 6. 环境配置：vi ~/.bashrc (打开文件.bashrc，按i进入编辑状态) 添加export PATH=/home/zgp/software/openmpi-1.2.6/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH: /home/zgp/software/openmpi-1.2.6/lib 关闭之后 source ~/.bashrc(使设置起作用，以后再新进入shell之后直接可以用mpiexec) 注意：openmpi卸载，可以直接删除安装文件 关于建立一个64位的OpenMPI，参考http://wiki.chem.vu.nl/dirac/ind ... for_64-bit_integers 为了防止该网址失效（曾经是效果，这个是我又重新找的，我将网页保存下来放到附件里面去了）[ Last edited by zhangguangping on 2012-3-5 at 15:50 ] |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：libolin3@tal.com - 附件 1 : How to build MPI libraries for 64-bit integers - Diracwiki.mht
2012-03-05 15:48:50, 126.4 K
» 收录本帖的淘贴专辑推荐
 基础知识 | VASP | 计算资料 | 小木虫的电子书籍 |
| 我的宝贝帖子 | 集群管理 | 沦落天涯 | 量子化学资料 |
» 猜你喜欢
北伊利诺伊大学(Northern Illinois University)机械系招收全奖博士生
已经有0人回复
-
第五届粉末衍射晶体结构解析及Rietveld精修高级研讨会
已经有44人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有287人回复
-
FDTD软件里的时域图像画图
已经有2人回复
-
复杂量子系统的新物态和新机理讲习班
已经有0人回复
-
导电原子力显微镜cAFM如何测试mcAFM(即磁导AFM)性能？
已经有0人回复
-
感谢小木虫，已完成目标
已经有0人回复
-
零点能
已经有2人回复
-
科研求助
已经有0人回复
-
【25申博】博导推荐求助
已经有5人回复
-
青岛大学李山东教授招生
已经有1人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- lammps并行安装最后一步make serial出错
已经有17人回复
- 新手求助一个quantum-espresso的使用问题！
已经有13人回复
- mpi是怎么装的？
已经有5人回复
- 很神奇的ANSYS13.0安装问题。。。10金币求解答
已经有7人回复
- gromacs编译安装
已经有11人回复
- mpich2安装问题
已经有8人回复
- fluent并行错误errno = 10054的解决办法，供参考交流
已经有40人回复
- vasp跨节点运行出错，mpiexec_node-1 (handle_stdin_input 1089)
已经有5人回复
- abinit并行版怎么安装
已经有19人回复
- 并行WIEN2K安装失败，如何解决，谢谢！
已经有9人回复
- 一不小心装了两个MPI，怎么卸载？
已经有3人回复
- GAMESS最新安装通过
已经有6人回复
- 请问MS-linux-cluster安装之后无法并行的问题？
已经有5人回复
- C++下的mpi.h头文件
已经有5人回复
- 【求助成功】vasp5.2并行安装不上
已经有18人回复
- 【求助】mpi vasp问题
已经有32人回复
- 【求助】安装mpich2时如何产生mpicc及mpifort
已经有9人回复
- 【求助】vasp并行安装mpich2的错误
已经有10人回复
- 【求助】编译siesta
已经有12人回复
- 【ghcacj个人文集】单机环境下安装openmpi使用Orca并行运算的方法介绍
已经有12人回复
- 【求助】安装MPI 【已解决】
已经有7人回复
- 【转帖】PBS安装
已经有11人回复
4楼2012-03-05 21:41:08
5楼2012-03-05 22:49:21
9楼2012-03-07 11:28:25
13楼2012-07-11 14:56:48
多谢！15楼2013-01-08 15:08:34
27楼2015-05-13 21:38:20
32楼2015-12-14 10:40:44
简单回复
2012-03-05 16:27
回复
五星好评 
2012-03-05 18:15
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
Y.-L.Guo6楼
2012-03-06 08:03
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
DFT+U7楼
2012-03-06 10:23
回复
五星好评 x谢谢分享~~
2012-03-06 11:13
回复
dreamfly_ykf10楼
2012-03-31 14:58
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
love526411楼
2012-04-27 08:06
回复
五星好评 感谢分享
c_chi12楼
2012-05-07 10:14
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
liuwu6586514楼
2012-10-02 21:57
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
furukawabona16楼
2013-01-18 22:47
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
WANG730317楼
2013-03-13 19:42
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
wangjb40118楼
2013-05-09 09:35
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
wangjb40119楼
2013-07-06 10:37
回复
顶一下，感谢分享！
dayedepps20楼
2013-07-15 12:58
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
caoyangli721楼
2013-11-22 15:49
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
Garfield_P22楼
2014-01-11 21:17
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
meiwei198823楼
2014-04-04 16:41
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
txwang24楼
2014-04-18 19:57
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
swuhaizhilan25楼
2015-01-24 09:24
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
futing122926楼
2015-01-28 14:18
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
ankolkol28楼
2015-06-16 19:28
回复
三星好评 顶一下，感谢分享！
zndx200629楼
2015-10-07 09:21
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
dapashi30楼
2015-10-19 10:13
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
xiamiaoren31楼
2015-12-13 22:21
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
jylaugh33楼
2016-04-30 23:17
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
muzhi30934楼
2016-11-29 20:00
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
mannunited35楼
2017-08-02 23:26
回复
五星好评 顶一下，感谢分享！
50