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MPI的安装(管理员和普通用户均可)
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本版块有的虫友在寻找MPI的安装，我现在把我以前的安装笔记分享出来，这儿以MPICH2和OpenMPI为例子，并且由于笔记比较早，所以版本有些老，对于新版本的安装，大家可以做一下参考。 下面的安装都是以普通用户为例子，如果是root用户安装，流程一样。 （一）MPICH2的安装 (各种版本的下载地址http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpich2/) 1.将mpich-1.2.7.tar.gz文件拷贝到一个临时的目录里面（如tem） 2.解压文件：$tar -zxvf mpich-1.2.7.tar.gz 3.进入解压后的目录：$cd mpich-1.2.7 4. $./configure -prefix=/home/zgp/software/mpich-1.2.7 -fc="pgf77 -Mx,119,0x200000"\ -f90="pgf90 -Mx,119,0x200000"\ -without-romio --without-mpe -opt=-O -rsh=ssh (若要使用的是ifort编译则设置成$./configure -prefix=/home/zgp/software/mpich-1.2.7 -fc=ifort -f90=ifort –f77=ifort -rsh=ssh) 5. $make 6. $make install 7环境配置：vi ~/.bashrc (打开文件.bashrc，按i进入编辑状态) 添加export PATH=/home/zgp/software/mpich-1.2.7/bin:$PATH 关闭之后 source ~/.bashrc(使设置起作用，以后再新进入shell之后直接可以用mpirun) 8.测试：$cd examples $make $mpirun –np 4 cpi ################## 注：下面的这个如果提前对用户配置好免SSH登录的话，就不会出现了，所以建议首先对用户配置免SSH登录，如果是root的SSH免密码登录已经配置好了的话，普通用户只需要进行如下操作即可： ssh-keygen -t rsa 后面直接连着三个“Enter”就可以， 然后运行命令： cat ~/.ssh/id_rsa.pub >> ~/.ssh/authorized_keys ###################### $The authenticity of host 'localhost (127.0.0.1)' can't be established. RSA key fingerprint is c0:48:84:0c:31:93:29:9a:d6:f6:07:08:7b:cc:33:db.Are you sure you want to continue connecting (yes/no)? $yes $Warning: Permanently added 'localhost' (RSA) to the list of known hosts. $zgp@localhost's password: 这时连续输入3次密码出现 $Process 0 on localhost Process 2 on localhost Process 3 on localhost Process 1 on localhost pi is approximately 3.1416009869231249, Error is 0.0000083333333318 wall clock time = 0.003906 表明安装成功。要想无密码并行，参考“ssh 免密码登录设置” 注意：mpich卸载，用/sbin/mpiuninstall文件 （二）OpenMPI的安装 (各种版本下载地址：http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.4/) 1.将openmpi-1.2.6.tar.gz文件拷贝到一个临时的目录里面（如tem） 2.解压文件：$tar -zxvf openmpi-1.2.6.tar.gz 3.进入解压后的目录：$cd openmpi-1.2.6 4.$ ./configure --prefix=/home/zgp/software/openmpi-1.2.6 F77=ifort FC=ifort (./configure --prefix=/home/zhangp/software/openmpi-1.4.3 CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort FFLAGS=-i8 FCFLAGS=-i8) –i8参数是使用Intel编译器编译64位的编译参数，否则是32位的。 关于OpenMPI的编译说明详见官网http://www.open-mpi.org/faq/?category=building#easy-build 5.$make all install 6. 环境配置：vi ~/.bashrc (打开文件.bashrc，按i进入编辑状态) 添加export PATH=/home/zgp/software/openmpi-1.2.6/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH: /home/zgp/software/openmpi-1.2.6/lib 关闭之后 source ~/.bashrc(使设置起作用，以后再新进入shell之后直接可以用mpiexec) 注意：openmpi卸载，可以直接删除安装文件 关于建立一个64位的OpenMPI，参考http://wiki.chem.vu.nl/dirac/ind ... for_64-bit_integers 为了防止该网址失效（曾经是效果，这个是我又重新找的，我将网页保存下来放到附件里面去了）[ Last edited by zhangguangping on 2012-3-5 at 15:50 ] |
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欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：libolin3@tal.com - 附件 1 : How to build MPI libraries for 64-bit integers - Diracwiki.mht
2012-03-05 15:48:50, 126.4 K
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