小木虫

各位大神，最近您因项目需求，紧急需要一个GROMACS的软件安装包，哪位大神有啊，求助求助，非常感谢！我的邮箱：'848168959qq.com'

Ms超算服务任何相关问题都可以解决实惠有意私聊我

Forcite几何优化，动力学都可以直接构建.pl文件，想问一下，退火的.pl文件如何构建？

本人是主要做合成方面的，近来因为工作需要要学习一些CADD方面的知识。发现这方面中文的教程或者视频少的可怜，自学起来难度很大。现求一CADD方面的交流学友，如果你现在正从事这方面的工作最好，如果你还在校，希望在研二以上，熟悉sybyl/MOE/Schrodin...

如何对层状模型的顶层金属原子添加滑动速度？

跪求msforcite模块计算界面张力的perl脚本文件研一萌新实在顶不住了

MultiplePostdocandPhDOpenPositionsinPolymerModelingandMachine-LearningatUniversityofConnecticutPleaserefertothelinkasbelowforthede...

请问各位老师，ATB生成的小分子拓扑文件，在添加抗衡离子的时候，现实无法识别原子类型，我也下载了ATB网站的GROMOS54A7_atb.ff，请问该怎样修改力场文件？？纯小白一枚，恳请老师能说详细一点

求助分子对接计算

我想用MS建CTF-1的模型，我没有教程，请问有朋友会吗

各位大佬，我个人原先是搞工程热物理的，由于老师接了新项目换课题了，转行到材料的分子动力学模拟，一点基础都没有，我该从何学起？该如何快速上手lammps？请各位大佬指点迷津。

求助materialstudio中的gulp模块中的调用服务器问题，只能使用一个核数，不能调用多个核数，求大佬帮忙解决下，谢谢谢谢

MS里施加力的时候发现单位是kcal/mol/Å，换算过来是N/mol吗？？设置速度的时候发现单位Å/ps，换算过来是m/s吗？还请大佬不吝赐教！！

分享一份自己课题组的内部资料，给零基础正准备学习LAMMPS的同学快速入门用。

从PDB下载了一个蛋白结构，但是PDB文件的蛋白结构本身含有小分子配体，我准备对接一个其他的小分子，请教各位大神，原来这个配体怎么去掉，是直接delete吗？还是要设置一些参数呢？谢谢

跑分子动力学计算均方回转半径的时候，跑的步长足够长，但是均方回转半径就是不能稳定在一个值左右，计算平均值也不符合与链长0.6的标度指数。链长越长，偏差越大。（链长分子数20-120）这是为什么。

我做的是气体在分子筛中的扩散问题，有几个关于Forcite中dynamics扩散的问题纠结了很久，请教大家。1.做扩散模拟时的平衡步和弛豫具体是如何实现呢？弛豫就是不固定分子筛，跑一下扩散吗？2.平衡步时间是加在总时间里面吗？算出总时间的MSD，再抛去平衡步时...

请问一下，ms做孔道扩散时，分子是用fixpressure吸附进去还是fixloading，看文献中很多直接loading的，那分子数目怎么确定

小白问题用Gaussian优化DMF分子为什么每次结构都会算崩,C和O两个原子会贴到一起，inputfile如下:%mem=120000MB%nprocshared=28%chk=DMFQs.chk#opt=(cartesian,fine)scrf=(cpcm...

用lammps模拟拉伸时，拉伸方向长度不变，出现“拉不动”的现象，下面是in文件，不知道问题在哪，边界条件为pps，z方向为拉伸方向。read_restartrestart.previous.2100000#——势函数pair_styleeam/fspair_...

请问有哪位虫友有Medea软件的安装包或是有相关学习群？可以分享一下吗？在这里谢谢大家了！

为什么上一级的学长们都这么说啊！好恐慌啊！

有人做Forcite模块不？有个问题请教一下。使用Forcite对一个周期性的矿物晶胞进行几何优化，选择不同力场还是出现晶格常数变化巨大的情况，而文献中则差异较小，请教一下是哪里的问题？或许可不可以对周期性晶胞使用其他模块比如Dmol3模块进行几何优化后再进行...

本人刚开始用ms做材料模拟，初步完成一些模拟后写了篇英文文章，内容不是很深入，求大神推荐容易发表的sci期刊。