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1974707632

新虫 (小有名气)


[交流] 磁珠偶联DNA、蛋白、抗体的探讨

分析研究中,我们常常需要用到磁珠偶联小分子、DNA/RNA、蛋白、抗体等用于后续的分析或Pull down实验。
试验中经常会失败,后来我们总结了这一过程主要影响因素。
因为我们实验室用得最多的就是羧基磁珠偶联氨基的配体:
1、配体浓度影响很大,一般来说高浓度配体更容易偶联成功;
2、磁珠特性影响很大,特别是磁珠表面羧基密度和磁珠的悬浮特性,我们经过筛选后来主要使用PuriMag的G系列羧基磁珠最好用,其最大特点就是基团密度高、悬浮好且磁吸快,在我们的实验中甚至好于dyna的myone系列;
3、羧基磁珠的活化一般不能超过1h,我们一般采用EDC/NHS活化;
4、偶联时间和温度相关,最保险是4度过夜孵育,这样易失活的配体影响最小;
5、封闭对磁珠的非特异吸附是有较大影响的,但是有时候由于磁珠本身的表面太疏水,不大能通过封闭改变其非特异吸附。一般来说BSA封闭好于氨基乙醇等。
6、非特异吸附一般主要是对蛋白的非特异吸附,对于非蛋白相关研究,不必过分在意;但对pull down实验还是影响比较大的。
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1974707632

新虫 (小有名气)


欢迎大家有什么问题和经验一起发上来交流一下。
2楼2021-07-18 18:22:08
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AmyZhouAQ

新虫 (初入文坛)



1974707632(金币+1): 谢谢参与
您好,我想用DNA链连接磁珠和铂纳米粒子,发现铂纳米粒子会吸附到磁珠的表面,虽然用BSA封闭了,也是会有吸附,这该怎么解决呢
11楼2021-11-06 13:35:18
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yubeihong

铁杆木虫 (职业作家)



1974707632(金币+1): 谢谢参与
很好,受启发。PuriMag的羧基磁珠偶联适配体效果如何?

发自小木虫IOS客户端
4楼2021-07-27 15:26:16
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shanying1197

捐助贵宾 (小有名气)



1974707632(金币+1): 谢谢参与
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采用EDC/NHS活化羧基时,EDC和NHS的浓度是多少?用PB配置吗?
12楼2021-12-23 20:51:13
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yubeihong

铁杆木虫 (职业作家)


引用回帖:
11楼: Originally posted by AmyZhouAQ at 2021-11-06 13:35:18
您好,我想用DNA链连接磁珠和铂纳米粒子,发现铂纳米粒子会吸附到磁珠的表面,虽然用BSA封闭了,也是会有吸附,这该怎么解决呢

非特异吸附只能降低,无法完全避免。注意静电互作!

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14楼2022-03-16 22:51:21
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yubeihong

铁杆木虫 (职业作家)


引用回帖:
12楼: Originally posted by shanying1197 at 2021-12-23 20:51:13
采用EDC/NHS活化羧基时,EDC和NHS的浓度是多少?用PB配置吗?

不是用tris,你找www.purimagbead.com要说明书,上面很详细。

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15楼2022-03-16 22:57:56
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yubeihong

铁杆木虫 (职业作家)


引用回帖:
16楼: Originally posted by lgz2017 at 2022-05-24 23:32:00
楼主你好 用BSA封闭的话,一般是多少进行封闭呢

BSA用1mg/ml封闭

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17楼2022-09-27 00:07:26
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1974707632

新虫 (小有名气)


引用回帖:
4楼: Originally posted by yubeihong at 2021-07-27 15:26:16
很好,受启发。PuriMag的羧基磁珠偶联适配体效果如何?

PuriMag磁珠用起来还不错,算国产中比较好的了。
6楼2021-08-07 20:35:45
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假大空

木虫之王 (文学泰斗)


顶顶顶
13楼2021-12-25 13:49:14
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lgz2017

新虫 (初入文坛)



1974707632(金币+1): 谢谢参与
楼主你好 用BSA封闭的话,一般是多少进行封闭呢

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16楼2022-05-24 23:32:00
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Jarnnney

新虫 (小有名气)



1974707632(金币+1): 谢谢参与
前辈您好,我现在也做磁珠偶联,但是活化完毕后调节体系微碱性之后加入适配体立刻团聚沉降了,这是为什么呢?可以加微信交流吗?想听前辈分享经验  Jarnnney258

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18楼2023-08-31 01:44:57
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Jarnnney

新虫 (小有名气)


我的磁珠和cdna在PBST中(PH7.4)37度偶联4.5h,之后加入含1%BSA的PBST(PH7.4)封闭时 立马聚沉,而且颜色由土黄色变成了铁锈红,这是为什么呢?

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19楼2023-09-26 10:31:15
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Sunny_777

新虫 (初入文坛)



1974707632(金币+1): 谢谢参与
楼主您好,我是用purimag的羧基磁珠(100ul)和我的有氨基修饰的核酸链(100ul 1nmol)进行2H的偶联 用的是EDC/NHS.的两步偶联法 然后用凝胶实验比较偶联前后 核酸链的浓度变化 结果显示完全没有偶联上 请问问题出在哪里呢可能?做过很多次实验了 嗯失败了 请您解惑!非常非常感谢了!

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20楼2023-10-01 00:05:37
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Sunny_777

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
19楼: Originally posted by Jarnnney at 2023-09-26 10:31:15
我的磁珠和cdna在PBST中(PH7.4)37度偶联4.5h,之后加入含1%BSA的PBST(PH7.4)封闭时 立马聚沉,而且颜色由土黄色变成了铁锈红,这是为什么呢?

同学你好 你也在做适配体偶联磁珠吗?可以交流一下吗?我也是!

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21楼2023-10-01 00:07:21
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Sunny_777

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
14楼: Originally posted by yubeihong at 2022-03-16 22:51:21
非特异吸附只能降低,无法完全避免。注意静电互作!
...

同学你好 我也是想用磁珠偶联末端修饰有氨基的核酸链 但是都偶联不上 具体的情况我在这个帖子下也做了评论 可以交流交流 你的这个偶联率怎么样嘛?非常非常感谢!

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22楼2023-10-01 00:09:14
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Jarnnney

新虫 (小有名气)


引用回帖:
21楼: Originally posted by Sunny_777 at 2023-10-01 00:07:21
同学你好 你也在做适配体偶联磁珠吗?可以交流一下吗?我也是!
...

加我微信交流呀Jarnnney258

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23楼2023-10-04 16:47:46
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Sunny_777

新虫 (初入文坛)


24楼2023-10-04 17:02:47
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tzynew3楼
2021-07-18 18:27   回复  
1974707632(金币+1): 谢谢参与
i 发自小木虫Android客户端
bjdxyxy5楼
2021-07-27 15:52   回复  
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nono20097楼
2021-08-09 06:24   回复  
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nono20098楼
2021-08-09 06:24   回复  
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nono20099楼
2021-08-09 06:24   回复  
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bjdxyxy10楼
2021-08-09 10:04   回复  
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